El Observatorio Político-Electoral para la Democracia es el área de la MOE que tiene por objetivo la investigación, el análisis y procesamiento de la información, la producción de conocimiento, y la elaboración de base de datos. Los principales temas de investigación del Observatorio incluyen el riesgo electoral, la violencia en la democracia y el impacto de las reformas electorales, y entre sus productos se destacan los Mapas de Riesgo Electoral, los informes periódicos sobre violencia política, social y comunal y presencia de grupos armados ilegales, los mapas de poder político, y las investigaciones electorales sobre el análisis de inscripción de cédulas y candidatos, revisión de escrutinios y resultados. Entre sus objetivos también están la planeación, seguimiento y monitoreo a proyectos estratégicos, y apoyar en actividades de investigación con las regionales de la MOE y con la ciudadanía.

El Observatorio Político-Electoral también coordina una plataforma técnica, conformada por reconocidos actores sociales y académicos, que diseña y aplica metodologías de producción y análisis de información geo-referenciada sobre diversas variables que pueden constituirse en factores de riesgo para los eventos electorales.